Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r48Q9EQ52 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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