Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms