Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Aph1cQ9DCZ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Aph1cQ9DCZ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms