Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms