Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap3s1Q9DCR2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s1Q9DCR2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms