Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Asf1bQ9DAP7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms