Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms