Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms