Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms