Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfn4Q9D6I3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms