Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms