Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms