Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D4W2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms