Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms