Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930564D02RikQ9D4S4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms