Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms