Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4933421I07RikQ9D420 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933421I07RikQ9D420 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms