Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
4933428G20RikQ9D3X4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms