Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms