Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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