Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ube2cQ9D1C1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube2cQ9D1C1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms