Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18l2Q9D174 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms