Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Tmem88Q9D0N8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem88Q9D0N8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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