Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Zbed3Q9D0L1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zbed3Q9D0L1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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