Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms