Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mms19Q9D071 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms