Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms