Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnbl1Q9CWL8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnbl1Q9CWL8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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