Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms