Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim8Q9CQQ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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