Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccer1Q9CQL2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms