Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms