Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab5aQ9CQD1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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