Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole4Q9CQ36 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms