Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nsmce3Q9CPR8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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