Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg5Q99PE8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg5Q99PE8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms