Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms