Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp1b1Q99LU0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms