Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed9Q99KF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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