Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp2Q99K23 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms