Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krcc1Q99JT5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms