Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec3Q99J72 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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