Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc8b1Q925Q3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms