Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SptssbQ925E8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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