Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neurl1Q923S6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1Q923S6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms