Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cts3Q91ZD5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cts3Q91ZD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms