Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atpaf2Q91YY4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms