Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klc3Q91W40 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms