Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms