Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps4aQ8VEJ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps4aQ8VEJ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms